Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KIAA0556O60303 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms