Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DENRO43583 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DENRO43583 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DENRO43583 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DENRO43583 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DENRO43583 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DENRO43583 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DENRO43583 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DENRO43583 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DENRO43583 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DENRO43583 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DENRO43583 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DENRO43583 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DENRO43583 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DENRO43583 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DENRO43583 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DENRO43583 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DENRO43583 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DENRO43583 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DENRO43583 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DENRO43583 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DENRO43583 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DENRO43583 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DENRO43583 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DENRO43583 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DENRO43583 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DENRO43583 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DENRO43583 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DENRO43583 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DENRO43583 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DENRO43583 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DENRO43583 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DENRO43583 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DENRO43583 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DENRO43583 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DENRO43583 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DENRO43583 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DENRO43583 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DENRO43583 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DENRO43583 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DENRO43583 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DENRO43583 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DENRO43583 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DENRO43583 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DENRO43583 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DENRO43583 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DENRO43583 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DENRO43583 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DENRO43583 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DENRO43583 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DENRO43583 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DENRO43583 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DENRO43583 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DENRO43583 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DENRO43583 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DENRO43583 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DENRO43583 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DENRO43583 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DENRO43583 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DENRO43583 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DENRO43583 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DENRO43583 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DENRO43583 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DENRO43583 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DENRO43583 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DENRO43583 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DENRO43583 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DENRO43583 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DENRO43583 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DENRO43583 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DENRO43583 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DENRO43583 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DENRO43583 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DENRO43583 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DENRO43583 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DENRO43583 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DENRO43583 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DENRO43583 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DENRO43583 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DENRO43583 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DENRO43583 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DENRO43583 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DENRO43583 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DENRO43583 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DENRO43583 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DENRO43583 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DENRO43583 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DENRO43583 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DENRO43583 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DENRO43583 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DENRO43583 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DENRO43583 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DENRO43583 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DENRO43583 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DENRO43583 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DENRO43583 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DENRO43583 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DENRO43583 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DENRO43583 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DENRO43583 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms