Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms