Protein–RNA interactions for Protein: O00468

AGRN, Agrin, humanhuman

Predictions only

Length 2,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRNO00468 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
AGRNO00468 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
AGRNO00468 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AGRNO00468 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AGRNO00468 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
AGRNO00468 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AGRNO00468 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AGRNO00468 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
AGRNO00468 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
AGRNO00468 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
AGRNO00468 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
AGRNO00468 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
AGRNO00468 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AGRNO00468 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AGRNO00468 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AGRNO00468 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
AGRNO00468 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AGRNO00468 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AGRNO00468 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AGRNO00468 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AGRNO00468 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AGRNO00468 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AGRNO00468 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AGRNO00468 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AGRNO00468 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AGRNO00468 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AGRNO00468 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AGRNO00468 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AGRNO00468 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AGRNO00468 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
AGRNO00468 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AGRNO00468 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AGRNO00468 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
AGRNO00468 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AGRNO00468 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AGRNO00468 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
AGRNO00468 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
AGRNO00468 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
AGRNO00468 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
AGRNO00468 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AGRNO00468 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AGRNO00468 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AGRNO00468 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AGRNO00468 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
AGRNO00468 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
AGRNO00468 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
AGRNO00468 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
AGRNO00468 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AGRNO00468 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AGRNO00468 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
AGRNO00468 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AGRNO00468 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AGRNO00468 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
AGRNO00468 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AGRNO00468 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
AGRNO00468 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AGRNO00468 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AGRNO00468 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AGRNO00468 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AGRNO00468 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AGRNO00468 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AGRNO00468 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AGRNO00468 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AGRNO00468 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
AGRNO00468 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
AGRNO00468 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
AGRNO00468 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
AGRNO00468 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
AGRNO00468 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
AGRNO00468 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
AGRNO00468 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
AGRNO00468 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AGRNO00468 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
AGRNO00468 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AGRNO00468 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
AGRNO00468 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AGRNO00468 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AGRNO00468 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AGRNO00468 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AGRNO00468 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AGRNO00468 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
AGRNO00468 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AGRNO00468 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AGRNO00468 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AGRNO00468 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AGRNO00468 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AGRNO00468 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
AGRNO00468 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
AGRNO00468 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AGRNO00468 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AGRNO00468 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AGRNO00468 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AGRNO00468 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AGRNO00468 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
AGRNO00468 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
AGRNO00468 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AGRNO00468 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AGRNO00468 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AGRNO00468 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
AGRNO00468 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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