Protein–RNA interactions for Protein: O00303

EIF3F, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3FO00303 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EIF3FO00303 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EIF3FO00303 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EIF3FO00303 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
EIF3FO00303 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EIF3FO00303 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EIF3FO00303 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EIF3FO00303 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EIF3FO00303 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EIF3FO00303 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
EIF3FO00303 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
EIF3FO00303 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EIF3FO00303 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EIF3FO00303 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EIF3FO00303 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EIF3FO00303 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EIF3FO00303 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EIF3FO00303 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EIF3FO00303 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EIF3FO00303 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EIF3FO00303 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EIF3FO00303 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EIF3FO00303 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms