Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN8O00124 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms