Protein–RNA interactions for Protein: B7ZW38

HNRNPCL3, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPCL3B7ZW38 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HNRNPCL3B7ZW38 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms