Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF316A6NFI3 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms