Protein–RNA interactions for Protein: V9GY05

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GY05 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
V9GY05 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
V9GY05 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
V9GY05 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
V9GY05 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
V9GY05 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
V9GY05 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
V9GY05 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
V9GY05 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
V9GY05 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
V9GY05 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
V9GY05 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
V9GY05 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
V9GY05 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
V9GY05 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
V9GY05 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
V9GY05 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
V9GY05 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
V9GY05 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
V9GY05 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
V9GY05 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
V9GY05 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
V9GY05 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
V9GY05 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
V9GY05 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
V9GY05 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
V9GY05 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
V9GY05 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
V9GY05 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
V9GY05 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
V9GY05 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
V9GY05 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
V9GY05 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
V9GY05 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
V9GY05 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
V9GY05 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
V9GY05 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
V9GY05 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
V9GY05 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
V9GY05 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
V9GY05 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
V9GY05 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
V9GY05 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
V9GY05 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
V9GY05 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
V9GY05 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
V9GY05 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
V9GY05 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
V9GY05 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
V9GY05 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
V9GY05 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
V9GY05 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
V9GY05 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
V9GY05 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
V9GY05 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
V9GY05 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
V9GY05 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
V9GY05 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
V9GY05 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
V9GY05 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
V9GY05 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
V9GY05 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
V9GY05 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
V9GY05 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
V9GY05 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
V9GY05 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
V9GY05 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
V9GY05 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
V9GY05 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
V9GY05 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
V9GY05 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
V9GY05 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
V9GY05 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
V9GY05 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
V9GY05 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
V9GY05 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
V9GY05 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
V9GY05 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
V9GY05 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
V9GY05 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
V9GY05 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
V9GY05 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
V9GY05 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
V9GY05 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
V9GY05 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
V9GY05 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
V9GY05 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
V9GY05 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
V9GY05 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
V9GY05 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
V9GY05 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
V9GY05 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
V9GY05 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
V9GY05 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
V9GY05 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
V9GY05 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
V9GY05 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
V9GY05 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
V9GY05 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
V9GY05 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms