Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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SH3BP1Q9Y3L3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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SH3BP1Q9Y3L3 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
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SH3BP1Q9Y3L3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
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SH3BP1Q9Y3L3 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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SH3BP1Q9Y3L3 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
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SH3BP1Q9Y3L3 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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SH3BP1Q9Y3L3 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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SH3BP1Q9Y3L3 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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SH3BP1Q9Y3L3 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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