Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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