Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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