Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HPS5Q9UPZ3 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HPS5Q9UPZ3 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HPS5Q9UPZ3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HPS5Q9UPZ3 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HPS5Q9UPZ3 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HPS5Q9UPZ3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HPS5Q9UPZ3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HPS5Q9UPZ3 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HPS5Q9UPZ3 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HPS5Q9UPZ3 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
HPS5Q9UPZ3 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms