Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL52

TMPRSS11E, Transmembrane protease serine 11E, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS11EQ9UL52 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMPRSS11EQ9UL52 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMPRSS11EQ9UL52 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMPRSS11EQ9UL52 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMPRSS11EQ9UL52 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMPRSS11EQ9UL52 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMPRSS11EQ9UL52 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMPRSS11EQ9UL52 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMPRSS11EQ9UL52 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TMPRSS11EQ9UL52 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMPRSS11EQ9UL52 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMPRSS11EQ9UL52 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMPRSS11EQ9UL52 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMPRSS11EQ9UL52 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMPRSS11EQ9UL52 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMPRSS11EQ9UL52 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMPRSS11EQ9UL52 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMPRSS11EQ9UL52 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMPRSS11EQ9UL52 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMPRSS11EQ9UL52 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMPRSS11EQ9UL52 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TMPRSS11EQ9UL52 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMPRSS11EQ9UL52 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMPRSS11EQ9UL52 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMPRSS11EQ9UL52 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMPRSS11EQ9UL52 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMPRSS11EQ9UL52 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMPRSS11EQ9UL52 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMPRSS11EQ9UL52 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMPRSS11EQ9UL52 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMPRSS11EQ9UL52 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMPRSS11EQ9UL52 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMPRSS11EQ9UL52 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMPRSS11EQ9UL52 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMPRSS11EQ9UL52 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMPRSS11EQ9UL52 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMPRSS11EQ9UL52 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMPRSS11EQ9UL52 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMPRSS11EQ9UL52 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TMPRSS11EQ9UL52 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TMPRSS11EQ9UL52 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMPRSS11EQ9UL52 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMPRSS11EQ9UL52 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMPRSS11EQ9UL52 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMPRSS11EQ9UL52 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TMPRSS11EQ9UL52 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMPRSS11EQ9UL52 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMPRSS11EQ9UL52 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TMPRSS11EQ9UL52 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TMPRSS11EQ9UL52 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMPRSS11EQ9UL52 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMPRSS11EQ9UL52 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMPRSS11EQ9UL52 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMPRSS11EQ9UL52 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMPRSS11EQ9UL52 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMPRSS11EQ9UL52 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMPRSS11EQ9UL52 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TMPRSS11EQ9UL52 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMPRSS11EQ9UL52 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMPRSS11EQ9UL52 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMPRSS11EQ9UL52 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMPRSS11EQ9UL52 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMPRSS11EQ9UL52 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMPRSS11EQ9UL52 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMPRSS11EQ9UL52 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TMPRSS11EQ9UL52 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TMPRSS11EQ9UL52 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TMPRSS11EQ9UL52 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TMPRSS11EQ9UL52 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TMPRSS11EQ9UL52 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms