Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

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Length 140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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