Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms