Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms