Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2A4

ABI3, ABI gene family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABI3Q9P2A4 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABI3Q9P2A4 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms