Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms