Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVW2

RLIM, E3 ubiquitin-protein ligase RLIM, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLIMQ9NVW2 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RLIMQ9NVW2 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms