Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms