Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms