Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ7

PCDHB16, Protocadherin beta-16, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB16Q9NRJ7 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms