Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8K7

C10orf88, Uncharacterized protein C10orf88, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf88Q9H8K7 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C10orf88Q9H8K7 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms