Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CTDSP1Q9GZU7 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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