Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms