Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms