Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms