Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms