Protein–RNA interactions for Protein: Q99417

MYCBP, c-Myc-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBPQ99417 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms