Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms