Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms