Protein–RNA interactions for Protein: Q96NE9

FRMD6, FERM domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD6Q96NE9 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FRMD6Q96NE9 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FRMD6Q96NE9 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FRMD6Q96NE9 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FRMD6Q96NE9 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FRMD6Q96NE9 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FRMD6Q96NE9 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FRMD6Q96NE9 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FRMD6Q96NE9 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FRMD6Q96NE9 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FRMD6Q96NE9 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FRMD6Q96NE9 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FRMD6Q96NE9 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FRMD6Q96NE9 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FRMD6Q96NE9 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FRMD6Q96NE9 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FRMD6Q96NE9 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FRMD6Q96NE9 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FRMD6Q96NE9 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FRMD6Q96NE9 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FRMD6Q96NE9 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FRMD6Q96NE9 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FRMD6Q96NE9 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FRMD6Q96NE9 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FRMD6Q96NE9 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FRMD6Q96NE9 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FRMD6Q96NE9 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FRMD6Q96NE9 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FRMD6Q96NE9 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FRMD6Q96NE9 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FRMD6Q96NE9 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FRMD6Q96NE9 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FRMD6Q96NE9 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FRMD6Q96NE9 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FRMD6Q96NE9 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FRMD6Q96NE9 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FRMD6Q96NE9 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FRMD6Q96NE9 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FRMD6Q96NE9 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FRMD6Q96NE9 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FRMD6Q96NE9 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FRMD6Q96NE9 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FRMD6Q96NE9 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FRMD6Q96NE9 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FRMD6Q96NE9 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FRMD6Q96NE9 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FRMD6Q96NE9 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FRMD6Q96NE9 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FRMD6Q96NE9 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FRMD6Q96NE9 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FRMD6Q96NE9 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FRMD6Q96NE9 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FRMD6Q96NE9 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FRMD6Q96NE9 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FRMD6Q96NE9 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FRMD6Q96NE9 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FRMD6Q96NE9 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FRMD6Q96NE9 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FRMD6Q96NE9 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FRMD6Q96NE9 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FRMD6Q96NE9 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FRMD6Q96NE9 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FRMD6Q96NE9 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FRMD6Q96NE9 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FRMD6Q96NE9 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FRMD6Q96NE9 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FRMD6Q96NE9 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FRMD6Q96NE9 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FRMD6Q96NE9 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FRMD6Q96NE9 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FRMD6Q96NE9 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FRMD6Q96NE9 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FRMD6Q96NE9 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FRMD6Q96NE9 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FRMD6Q96NE9 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FRMD6Q96NE9 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FRMD6Q96NE9 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FRMD6Q96NE9 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FRMD6Q96NE9 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FRMD6Q96NE9 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FRMD6Q96NE9 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FRMD6Q96NE9 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FRMD6Q96NE9 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FRMD6Q96NE9 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FRMD6Q96NE9 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FRMD6Q96NE9 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FRMD6Q96NE9 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FRMD6Q96NE9 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FRMD6Q96NE9 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FRMD6Q96NE9 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FRMD6Q96NE9 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FRMD6Q96NE9 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FRMD6Q96NE9 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FRMD6Q96NE9 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FRMD6Q96NE9 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FRMD6Q96NE9 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FRMD6Q96NE9 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FRMD6Q96NE9 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FRMD6Q96NE9 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FRMD6Q96NE9 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms