Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms