Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC17Q96LX7 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC17Q96LX7 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC17Q96LX7 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC17Q96LX7 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC17Q96LX7 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC17Q96LX7 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC17Q96LX7 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC17Q96LX7 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC17Q96LX7 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC17Q96LX7 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC17Q96LX7 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC17Q96LX7 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC17Q96LX7 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC17Q96LX7 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC17Q96LX7 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC17Q96LX7 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC17Q96LX7 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC17Q96LX7 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC17Q96LX7 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC17Q96LX7 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC17Q96LX7 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC17Q96LX7 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC17Q96LX7 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC17Q96LX7 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC17Q96LX7 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC17Q96LX7 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC17Q96LX7 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC17Q96LX7 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC17Q96LX7 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC17Q96LX7 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC17Q96LX7 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC17Q96LX7 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC17Q96LX7 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC17Q96LX7 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC17Q96LX7 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC17Q96LX7 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC17Q96LX7 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC17Q96LX7 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC17Q96LX7 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC17Q96LX7 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC17Q96LX7 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC17Q96LX7 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC17Q96LX7 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC17Q96LX7 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC17Q96LX7 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC17Q96LX7 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC17Q96LX7 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC17Q96LX7 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC17Q96LX7 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC17Q96LX7 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC17Q96LX7 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC17Q96LX7 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CCDC17Q96LX7 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
CCDC17Q96LX7 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC17Q96LX7 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC17Q96LX7 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC17Q96LX7 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC17Q96LX7 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC17Q96LX7 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC17Q96LX7 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC17Q96LX7 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC17Q96LX7 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC17Q96LX7 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC17Q96LX7 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC17Q96LX7 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC17Q96LX7 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC17Q96LX7 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC17Q96LX7 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC17Q96LX7 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC17Q96LX7 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC17Q96LX7 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC17Q96LX7 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC17Q96LX7 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC17Q96LX7 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC17Q96LX7 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC17Q96LX7 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC17Q96LX7 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC17Q96LX7 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC17Q96LX7 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC17Q96LX7 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC17Q96LX7 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC17Q96LX7 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC17Q96LX7 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC17Q96LX7 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC17Q96LX7 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC17Q96LX7 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC17Q96LX7 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC17Q96LX7 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC17Q96LX7 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC17Q96LX7 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC17Q96LX7 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC17Q96LX7 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC17Q96LX7 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC17Q96LX7 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC17Q96LX7 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC17Q96LX7 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC17Q96LX7 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC17Q96LX7 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC17Q96LX7 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms