Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

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Length 92 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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