Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBE2E3Q969T4 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBE2E3Q969T4 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBE2E3Q969T4 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBE2E3Q969T4 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBE2E3Q969T4 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE2E3Q969T4 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE2E3Q969T4 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE2E3Q969T4 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE2E3Q969T4 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE2E3Q969T4 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE2E3Q969T4 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE2E3Q969T4 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE2E3Q969T4 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE2E3Q969T4 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE2E3Q969T4 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE2E3Q969T4 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE2E3Q969T4 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE2E3Q969T4 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE2E3Q969T4 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE2E3Q969T4 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE2E3Q969T4 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE2E3Q969T4 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE2E3Q969T4 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE2E3Q969T4 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE2E3Q969T4 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE2E3Q969T4 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE2E3Q969T4 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE2E3Q969T4 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE2E3Q969T4 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE2E3Q969T4 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE2E3Q969T4 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE2E3Q969T4 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE2E3Q969T4 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE2E3Q969T4 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE2E3Q969T4 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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UBE2E3Q969T4 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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UBE2E3Q969T4 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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UBE2E3Q969T4 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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UBE2E3Q969T4 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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UBE2E3Q969T4 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE2E3Q969T4 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE2E3Q969T4 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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UBE2E3Q969T4 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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UBE2E3Q969T4 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
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UBE2E3Q969T4 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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UBE2E3Q969T4 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE2E3Q969T4 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE2E3Q969T4 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE2E3Q969T4 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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UBE2E3Q969T4 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE2E3Q969T4 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE2E3Q969T4 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE2E3Q969T4 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE2E3Q969T4 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE2E3Q969T4 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE2E3Q969T4 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE2E3Q969T4 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE2E3Q969T4 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE2E3Q969T4 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE2E3Q969T4 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE2E3Q969T4 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE2E3Q969T4 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE2E3Q969T4 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE2E3Q969T4 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE2E3Q969T4 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE2E3Q969T4 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE2E3Q969T4 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE2E3Q969T4 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE2E3Q969T4 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE2E3Q969T4 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE2E3Q969T4 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE2E3Q969T4 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE2E3Q969T4 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE2E3Q969T4 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE2E3Q969T4 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE2E3Q969T4 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE2E3Q969T4 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE2E3Q969T4 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE2E3Q969T4 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE2E3Q969T4 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE2E3Q969T4 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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