Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms