Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms