Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DNAAF3Q8N9W5 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DNAAF3Q8N9W5 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAAF3Q8N9W5 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAAF3Q8N9W5 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAAF3Q8N9W5 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAAF3Q8N9W5 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAAF3Q8N9W5 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAAF3Q8N9W5 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAAF3Q8N9W5 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAAF3Q8N9W5 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAAF3Q8N9W5 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAAF3Q8N9W5 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAAF3Q8N9W5 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAAF3Q8N9W5 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAAF3Q8N9W5 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAAF3Q8N9W5 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAAF3Q8N9W5 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAAF3Q8N9W5 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAAF3Q8N9W5 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAAF3Q8N9W5 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAAF3Q8N9W5 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAAF3Q8N9W5 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAAF3Q8N9W5 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAAF3Q8N9W5 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAAF3Q8N9W5 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAAF3Q8N9W5 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAAF3Q8N9W5 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAAF3Q8N9W5 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAAF3Q8N9W5 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAAF3Q8N9W5 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAAF3Q8N9W5 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAAF3Q8N9W5 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAAF3Q8N9W5 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
DNAAF3Q8N9W5 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
DNAAF3Q8N9W5 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
DNAAF3Q8N9W5 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DNAAF3Q8N9W5 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DNAAF3Q8N9W5 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DNAAF3Q8N9W5 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DNAAF3Q8N9W5 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DNAAF3Q8N9W5 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DNAAF3Q8N9W5 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DNAAF3Q8N9W5 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DNAAF3Q8N9W5 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DNAAF3Q8N9W5 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DNAAF3Q8N9W5 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DNAAF3Q8N9W5 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DNAAF3Q8N9W5 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DNAAF3Q8N9W5 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DNAAF3Q8N9W5 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DNAAF3Q8N9W5 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DNAAF3Q8N9W5 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DNAAF3Q8N9W5 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
DNAAF3Q8N9W5 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DNAAF3Q8N9W5 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
DNAAF3Q8N9W5 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DNAAF3Q8N9W5 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DNAAF3Q8N9W5 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DNAAF3Q8N9W5 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DNAAF3Q8N9W5 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DNAAF3Q8N9W5 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DNAAF3Q8N9W5 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DNAAF3Q8N9W5 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DNAAF3Q8N9W5 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DNAAF3Q8N9W5 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DNAAF3Q8N9W5 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DNAAF3Q8N9W5 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DNAAF3Q8N9W5 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
DNAAF3Q8N9W5 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DNAAF3Q8N9W5 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DNAAF3Q8N9W5 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DNAAF3Q8N9W5 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DNAAF3Q8N9W5 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DNAAF3Q8N9W5 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DNAAF3Q8N9W5 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DNAAF3Q8N9W5 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DNAAF3Q8N9W5 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DNAAF3Q8N9W5 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
DNAAF3Q8N9W5 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DNAAF3Q8N9W5 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DNAAF3Q8N9W5 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DNAAF3Q8N9W5 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DNAAF3Q8N9W5 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DNAAF3Q8N9W5 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DNAAF3Q8N9W5 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DNAAF3Q8N9W5 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DNAAF3Q8N9W5 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
DNAAF3Q8N9W5 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DNAAF3Q8N9W5 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DNAAF3Q8N9W5 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DNAAF3Q8N9W5 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DNAAF3Q8N9W5 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DNAAF3Q8N9W5 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DNAAF3Q8N9W5 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DNAAF3Q8N9W5 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DNAAF3Q8N9W5 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DNAAF3Q8N9W5 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DNAAF3Q8N9W5 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DNAAF3Q8N9W5 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms