Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms