Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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DTX3Q8N9I9 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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DTX3Q8N9I9 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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