Protein–RNA interactions for Protein: Q86VB7

CD163, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163Q86VB7 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms