Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR0

NLRP9, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 991 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP9Q7RTR0 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NLRP9Q7RTR0 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms