Protein–RNA interactions for Protein: Q6PI25

CNIH2, Protein cornichon homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH2Q6PI25 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNIH2Q6PI25 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms