Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms