Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms