Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms