Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBL2

ZNF628, Zinc finger protein 628, humanhuman

Predictions only

Length 1,059 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF628Q5EBL2 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms