Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms